The San Diego Brewing Company abrió en 1896 como la primera cervecería comercial en el Condado de San Diego; Alonzo Horton, el padre de la moderna San Diego, fue uno de los fundadores. En ese momento era la empresa manufacturera más grande del condado. Estaba ubicado en la calle 32 en San Diego. Cerró en 1920 debido a la prohibición. Se reabrió en 1935 y continuó en funcionamiento hasta 1942, cuando fue desplazado por la Estación Naval de la calle 32 de la Armada de los Estados Unidos. Un brewpub con el mismo nombre ahora opera en el vecindario de Mission Valley.,
el antiguo edificio Mission Brewery en San Diego
Mission Brewery, ubicado en el barrio Middletown de San Diego, abrió sus puertas en 1913 y cerró debido a la prohibición. Nunca fue reabierto como una fábrica de cerveza, pero el edificio de ladrillo de cinco pisos fue reutilizado varias veces, para la extracción de algas hasta la década de 1980 y finalmente como un edificio de oficinas, todavía en funcionamiento. El edificio fue incluido en el Registro Nacional de Lugares históricos en 1989., El nombre de Mission Brewery fue revivido en 2007 por una cervecería ubicada en el histórico Wonder Bread building en el Centro de San Diego.
La Aztec Brewing Company fue fundada en Mexicali, Baja California, México, en 1921 como Cervecería Azteca SA. Durante la prohibición ayudó a suministrar a los estadounidenses la cerveza que no podían comprar legalmente en los Estados Unidos. La compañía se mudó a San Diego en 1933, tras la derogación de la prohibición, y se convirtió en la cervecería más grande de San Diego. Estaba ubicado en la calle principal del Barrio Logan., Presentaba un gran Rathskeller, o salón de cerveza del sótano, decorado con murales, pinturas y tallas de madera de José Moya del Pino. En 1944 Aztec era la única cervecería que seguía operando en el sur de California. La compañía fue comprada por Altes Brewing Company en 1948; Altes fue comprada por la National Brewing Company, que cerró Aztec Brewing Company en 1953. Durante los siguientes 36 años no hubo cerveza comercial local en el Condado de San Diego. El nombre Aztec Brewing Company ha sido revivido en una cervecería Vista que abrió sus puertas en 2011.,
durante la prohibición (1920-1933), los habitantes de San Diego todavía podían beber cerveza cruzando la frontera hacia México. En la antigua pequeña ciudad de Tijuana se construyeron más de 180 cantinas para servir a los visitantes estadounidenses, y la población de la ciudad se multiplicó por diez entre 1920 y 1930. Varias cervecerías modernas fueron construidas en Mexicali para satisfacer la demanda.
antes de la prohibición había siete cervecerías en San Diego. Después de la derogación hubo tres: Aztec Brewing Company, San Diego Brewing Company y Balboa Brewing Company., Estos pronto fueron comprados por las tres grandes compañías cerveceras nacionales (Anheuser-Busch, Coors y Miller) o expulsados del negocio por las agresivas prácticas de marketing de las tres grandes. Desde 1953 hasta la década de 1980, el mercado local de cerveza estuvo dominado por los grandes cerveceros nacionales, con la alternativa de ser la cerveza importada de México. Pero los cambios en las leyes nacionales y estatales a finales de la década de 1970 hicieron que la elaboración casera fuera legal, y en 1982 California permitió que las cervecerías operaran restaurantes en sus instalaciones, lo que hizo posible los brewpubs.,
la cervecería Karl Strauss en Carlsbad
en 1989 La Karl Strauss Brewing Company abrió una cervecería y un brewpub en Columbia Street en el Centro de San Diego y se expandió a distribution brewing en 1991. Esta fue la primera cervecería comercial en San Diego desde 1953, y para muchos consumidores de San Diego fue su primera exposición a la cerveza recién elaborada y a estilos como amber lager y pale ale. A mediados de la década de 1990 apareció una segunda ola de cervecerías artesanales, lideradas por Pizza Port, Stone y Alesmith., El movimiento de la cerveza artesanal local se inspiró en parte en los aficionados a la cerveza casera, con el apoyo de la tienda Home Brew Mart, que abrió sus puertas en 1992 y más tarde escindió la Ballast Point Brewing Company.
Los Festivales de cerveza promovieron los nuevos estilos y educaron a una nueva generación de bebedores de cerveza. En 1997 los cerveceros locales Tomme Arthur y Tom Nickel organizaron el primer evento de este tipo, el Strong Ale Festival (todavía un evento anual), y en 1998 agregaron el Real Ale Festival (descontinuado después de 2012). Se agregaron otros festivales, y en 2009 el gremio de Cerveceros de San Diego lanzó una semana anual de la cerveza., San Diego se estableció tan bien en el mundo cervecero que la competencia Bienal de la Copa Mundial de cerveza se celebró allí en 2004; 11 medallas (de más de 200) fueron para los locales. San Diego fue anfitrión del evento de nuevo en 2008, con 14 medallas, y en 2012, con 16 medallas. En el Great American Beer Festival 2015, los cerveceros del Condado de San Diego trajeron a casa un total de 20 medallas (6 de oro, 2 de plata y 11 de Bronce).
en 2013-2014, el Centro de Historia de San Diego presentó una exposición especial sobre la historia de la cerveza en el condado, titulada «Bottled and Kegged: San Diego Craft Beer Culture».