Figura 1. Selecione primases multifuncionais em três domínios da vida (eukaryota, archaea e bactérias). A capacidade de uma primase para realizar uma determinada actividade é indicada por uma marca de verificação. Adaptado de.
a família AEP de primases-polimerases tem diversas características além de fazer apenas primers., Além de desobstrução do DNA durante a replicação, AEP enzimas pode ter funções adicionais no processo de replicação do DNA, tais como polimerização do DNA ou RNA, de terminais de transferência, translesion síntese (TLS), não-homólogos fim de juntar (NHEJ), e, possivelmente, em recomeçar a replicação retardada forks. Primases normalmente sintetizam primers a partir de ribonucleotídeos (NTPs); no entanto, primases com capacidades de polimerase também têm uma afinidade para desoxirribonucleotídeos (dNTPs)., As Primases com funcionalidade terminal transferase são capazes de adicionar nucleótidos à extremidade 3′ de uma cadeia de DNA independentemente de um modelo. Outras enzimas envolvidas na replicação do ADN, como as helicases, também podem apresentar actividade da primase.
Em eucariotas e archaeaEdit
Humanos PrimPol (ccdc111) serve tanto primase e polimerase funções, como muitos de bactérias primases; exposições de terminal transferase atividade na presença de manganês; e desempenha um papel significativo na translesion síntese e reiniciar a replicação retardada forks., PrimPol é ativamente recrutado para locais danificados através de sua interação com RPA, uma proteína adaptadora que facilita a replicação e reparação do DNA. PrimPol tem um domínio de dedo de zinco semelhante ao de algumas primases virais, que é essencial para a síntese da translação e atividade da primase e pode regular o comprimento da Primera. Ao contrário da maioria das primases, o PrimPol é unicamente capaz de iniciar cadeias de ADN com dNTPs.
PriS, a pequena subunidade da primase archaeal, tem um papel na síntese de translação (TLS) e pode contornar lesões comuns do DNA., A maioria das archaea não possui polimerases especializadas que realizam TLS em eucariotas e bactérias. PriS sozinho sintetiza preferencialmente cadeias de DNA; mas em combinação com PriL, a grande subunidade, A atividade de RNA polimerase é aumentada.
em Sulfolobus solfataricus, o heterodímero primário PriSL pode actuar como uma primase, polimerase e transferase terminal. Pensa-se que PriSL inicia a síntese de primer com NTPs e depois muda para dNTPs. A enzima pode polimerizar RNA ou cadeias de ADN, com produtos de ADN que chegam a atingir 7000 nucleótidos (7 kb)., Sugere-se que esta dupla funcionalidade pode ser uma característica comum das primases archaeal.
em primases bacteriaEdit
AEP multifuncional também aparecem em bactérias e fagos que as infectam. Eles podem exibir novas organizações de domínio com domínios que trazem ainda mais funções além da polimerização.
o ligamento bacteriano (A0R3R7) está primariamente envolvido na Via NHEJ. Possui uma superfamília polymerase/domínio primase, um domínio 3′-fosfoesterase e um domínio ligase. É também capaz de primase, DNA e RNA polimerase, e atividade terminal transferase., A atividade de polimerização do DNA pode produzir cadeias com mais de 7000 nucleótidos (7 kb) de comprimento, enquanto a polimerização do RNA produz cadeias com até 1 kb de comprimento.
nos vírus e plasmidsEdit
as enzimas AEP estão espalhadas, e podem ser encontradas codificadas em elementos genéticos móveis, incluindo vírus/fagos e plasmídeos. Eles ou os usam como uma única proteína de replicação ou em combinação com outras proteínas associadas à replicação, tais como helicases e, menos frequentemente, DNA polimerases., Enquanto a presença de AEP nos vírus eucarióticos e archaeal é esperada, na medida em que espelham os seus hospedeiros, vírus bacterianos e plasmídeos, também codificam frequentemente enzimas AEP-superfamília como codificam primases da família DnaG. Uma grande diversidade de famílias de AEP foi descoberta em vários plasmídeos bacterianos por pesquisas genômicas comparativas. Sua história evolutiva é atualmente desconhecida, já que estas encontradas em bactérias e baceriofagos parecem muito diferentes de seus homólogos archaeo-eucarióticos para uma recente transferência horizontal de genes.,
MCM-like helicase in Bacillus cereus strain ATCC 14579 (BcMCM; Q81EV1) é uma helicase SF6 fundida com uma PRIMASE AEP. A enzima tem funções de primase e polimerase para além da função helicase. O gene que o codifica é encontrado numa profecia. Tem homologia de ORF904 do plasmídeo pRN1 a partir de Sulfolobus islandicus, que tem um domínio de PRIMPOL AEP. Vaccinia virus D5 and HSV Primase are examples of AEP-helicase fusion as well.
PolpTN2 é uma primase Archaeal encontrada no plasmídeo TN2., A fusão de domínios homólogos a PriS e PriL, exibe a atividade da primase e da DNA polimerase, bem como a função da transferase terminal. Ao contrário da maioria das primases, PolpTN2 forma primers compostos exclusivamente de dNTPs. Inesperadamente, quando o domínio PriL-like foi truncado, PolpTN2 também poderia sintetizar DNA no modelo de RNA, ou seja, atuou como uma DNA polimerase dependente de RNA (transcriptase reversa).
mesmo as primases DnaG podem ter funções extras, se dados os domínios certos. O phage T7 gp4 é uma fusão DnaG primase-helicase, e executa ambas as funções na replicação.