Habitats des archées

les archées sont des micro-organismes qui définissent les limites de la vie sur Terre. Ils ont été initialement découverts et décrits dans des environnements extrêmes, tels que les évents hydrothermaux et les sources chaudes terrestres. Ils ont également été trouvés dans une gamme variée d’environnements hautement Salins, acides et anaérobies.

bien que beaucoup d’archées cultivées soient extrêmophiles, ces organismes dans leurs habitats extrêmes respectifs ne représentent qu’une minorité de la diversité totale du domaine des archées. La majorité des archées ne peuvent pas être cultivées en laboratoire, et leur présence omniprésente dans les habitats mondiaux a été réalisée grâce à l’utilisation de techniques indépendantes de la culture. Une technique couramment utilisée indépendamment de la culture est l’isolement et l’analyse des acides nucléiques (c.-à-d.,, ADN et ARN) directement à partir d’un environnement, plutôt que l’analyse d’échantillons de culture isolés du même environnement. Des études indépendantes de la Culture ont montré que les archées sont abondantes et remplissent des rôles écologiques importants dans les écosystèmes froids et tempérés. Les organismes non cultivés de la subdivision Crenarchaeota sont supposés être les organismes oxydant l’ammoniac les plus abondants dans les sols et représenter une grande proportion (environ 20%) des microorganismes présents dans le picoplancton dans les océans du monde., Dans la subdivision Euryarchaeota, les organismes non cultivés dans les sédiments marins profonds sont responsables de l’élimination du méthane, un puissant gaz à effet de serre, par oxydation anaérobie du méthane stocké dans ces sédiments. En revanche, on estime que les euryarchées méthanogènes non cultivées (productrices de méthane) provenant d’environnements anaérobies terrestres, tels que les rizières, génèrent environ 10 à 25% des émissions mondiales de méthane.

Les représentants cultivés des Crenarchaeota proviennent d’environnements à haute température, tels que les sources chaudes et les évents hydrothermaux sous-marins. De même, les membres cultivés des Euryarchaeota comprennent des organismes isolés des environnements chauds, des organismes méthanogènes et des organismes qui poussent vigoureusement dans des environnements riches en sel (halophiles)., Les organismes de la lignée Korarchaeota et de la lignée Nanoarchaeota proposée habitent également des environnements à haute température; cependant, les nanoarchaea sont très inhabituels car ils se développent et se divisent à la surface d’une autre archée, Ignicoccus. Les nanoarchées, découvertes en 2002, contiennent à la fois la plus petite cellule vivante connue (1/100e de la taille d’Escherichia coli) et le plus petit génome connu (112 kilobases ; à titre de comparaison, le génome humain contient 3,2 milliards de paires de bases)., Les membres des Korarchaeota et des Nanoarchaeota n’ont pas été détectés en culture pure; ils ont plutôt été détectés uniquement dans des cultures de laboratoire mixtes.

les archées vivent également en association avec les eucaryotes. Par exemple, les archées méthanogènes sont présentes dans le système digestif de certains animaux, y compris les humains. Certaines archées forment des relations symbiotiques avec les éponges. En fait, Cenarchaeum symbiosum a été cultivé en laboratoire avec son éponge hôte et a été le premier Crenarchaeota nonthermophile à être cultivé et décrit., C’était le premier organisme considéré pour la classification dans la lignée proposée des Thaumarchaeota.