Le 2 décembre 1998, Ferentz a été embauché en tant que 26e entraîneur principal de football de L’Iowa pour remplacer Hayden Fry qui prend sa retraite. L’équipe a connu des difficultés pendant les deux premières saisons de Ferentz avec un bilan combiné de 4-19, mais les Hawkeyes ont remporté leur première participation au bowl de L’ère Ferentz après une saison de 7-5 en 2001. Ils ont battu Texas Tech À L’Alamo Bowl, 19-16.

la saison 2002 s’avérera mémorable pour Ferentz et les Hawkeyes. L’équipe a terminé la saison régulière avec un dossier de 11-1; sa seule défaite venant à Iowa State., Ils ont partagé le championnat de la conférence Big Ten avec Ohio State, alors que les deux équipes ont terminé 8-0 en conférence. Le Quarterback Brad Banks a remporté le Davey O’Brien Award du meilleur quarterback et a terminé deuxième au scrutin du trophée Heisman face à Carson Palmer de L’USC. Le Tight end Dallas Clark a remporté le prix John Mackey de cette saison,et le placekicker Nate Kaeding a remporté le Prix Lou Groza. Ferentz a été nommé entraîneur de l’année par L’Associated Press pour ses efforts. Iowa a reçu sa première invitation BCS, perdant contre USC dans L’Orange Bowl 2003, 38-17.,

malgré la perte de plusieurs aînés à la suite de l’obtention de leur diplôme, les Hawkeyes ont compilé une fiche de 9-3 en saison régulière en 2003. Ils ont battu la Floride 37-17 à L’Outback Bowl le 1er janvier 2004, pour leur première victoire en Janvier depuis 1959. Cela a valu aux Hawkeyes un classement national #8 dans le sondage AP et le sondage des entraîneurs à la fin de la saison. Le plaqueur offensif Robert Gallery a été le gagnant du Trophée Outland de cette saison; après la saison, les Raiders D’Oakland l’ont choisi avec le deuxième choix au total de la Draft 2004 de la NFL.,

Ferentz a dû faire face à de multiples blessures aux arrières des Hawkeyes et à la mort de son père, John, au cours de la saison 2004. Néanmoins, les Hawkeyes ont compilé un bilan de 9-2 en saison régulière, partageant le championnat de la Big Ten Conference avec Michigan après une victoire 30-7 sur Wisconsin le 20 novembre. Pour la deuxième fois en trois saisons, Ferentz a été nommé entraîneur de l’année de la conférence Big Ten. Le 1er janvier 2005, ils ont battu LSU, 30-25, après une passe de touché palpitante de 56 verges de Drew tate à Warren Holloway alors que le temps expirait dans le Capital One Bowl., Cela a donné à Ferentz sa troisième saison consécutive de dix victoires avec les Hawkeyes et un autre classement national #8.

Les Hawkeyes se sont inclinés 7-4 au cours de la saison régulière 2005. Après des défaites en début de saison contre Iowa State et Ohio State et des défaites proches contre Michigan et Northwestern, ils terminent la saison avec des victoires sur Wisconsin et Minnesota pour gagner un deuxième voyage à L’Outback Bowl pour affronter la Floride le 2 janvier 2006. Cette fois, cependant, les Gators ont obtenu une mesure de revanche pour leur perte deux ans plus tôt, comme les Hawkeyes ont perdu contre la Floride, 31-24., On a beaucoup parlé de l’arbitrage dans ce match, car il y avait 13 appels manqués ou mauvais contre les Hawkeyes qui ont directement influencé le résultat. La NCAA a fait une reconnaissance officielle de ce problème.

Iowa a commencé la saison 2006 fort, remportant leurs quatre premiers matchs avant de perdre contre Ohio State, le mieux classé. Après un départ de 5-1, cependant, les Hawkeyes se sont effondrés en fin de match, perdant cinq de leurs six derniers matchs. L’Iowa a subi des pertes choquantes contre Northwestern et Indiana et a perdu des matchs de rivalité avec le Wisconsin et le Minnesota., Les Hawkeyes ont terminé la saison régulière avec un dossier de 6-6 et ont accepté une invitation à L’Alamo Bowl 2006, sixième match de bowl de suite de L’Iowa. Jouant en tant qu’outsiders de neuf points contre les champions nationaux en titre Texas, Iowa a perdu L’Alamo Bowl par un score de 26-24.

en 2007, les Hawkeyes de Ferentz ont commencé 2-4 et ont perdu leurs trois premiers matchs de conférence. Une victoire contrariée sur l « Illinois a mis fin à une série de neuf défaites de conférence pour l » Iowa, et les Hawkeyes ont clôturé la saison Big Ten en remportant leurs trois derniers matchs de conférence., Cependant, une défaite décevante en finale de la saison contre Western Michigan a porté le record de saison des Hawkeyes à 6-6. Bien que L’Iowa était éligible au bowl, les Hawkeyes n’ont pas reçu d’offre au bowl, accrochant la série de six apparitions consécutives au bowl de L’Iowa.

en 2008, Ferentz et les Hawkeyes ont commencé fort avec des victoires sur son ancienne équipe, Maine, Florida International et son rival Iowa State, mais des défaites proches contre Pitt, Northwestern et Michigan State ont laissé L’Iowa avec un dossier de 3-3. Iowa a ensuite remporté cinq de leurs six prochains matchs, y compris un revers 24-23 de Penn State, classé numéro 3 et invaincu., Après avoir terminé la saison régulière à 8-4, Iowa a accepté une invitation à L’Outback Bowl où ils ont battu les Gamecocks de la Caroline du Sud, 31-10.

L’équipe de football Hawkeye 2009 a pris le meilleur départ de l’histoire de l’école jusque-là. Des victoires étroites à domicile sur le nord de L’Iowa et de L’Arkansas State, associées à des victoires à deux chiffres sur la route sur Penn State et le Wisconsin, ont alimenté un départ 7-0., Ferentz ‘ 2009 Hawks est devenu la première équipe de L’Iowa à gagner huit matchs pour commencer une saison en gagnant à Michigan State, 15-13, avec une passe de touché sur le dernier jeu du match. Après avoir battu Indiana pour porter leur dossier à 9-0, les Hawks ont perdu le quart-arrière Ricky Stanzi sur blessure dans une défaite contrariée contre Northwestern. Iowa a ensuite perdu le match de championnat Big Ten de facto à Ohio State, 27-24, en prolongation. Les Hawkeyes ont blanchi Minnesota, 12-0, pour terminer la saison régulière avec un bilan de 10-2 et ont été sélectionnés pour leur deuxième match de BCS bowl sous Ferentz en étant invités à L’Orange Bowl 2010., Iowa a battu Georgia Tech, 24-14, pour remporter la première victoire de l’école au BCS bowl et leur première victoire dans un bowl de niveau BCS depuis le Rose Bowl de 1959. Iowa a terminé avec une fiche de 11-2 qui a égalé le record de l’école pour les victoires en une saison et les Hawkeyes ont obtenu le classement #7 dans le sondage AP et le sondage des entraîneurs, leur meilleur résultat depuis la saison 1960.

Après trois saisons médiocres au cours desquelles L’Iowa n’a Remporté qu’un 19-19 combiné et une défaite humiliante au TaxSlayer Bowl, la saison 2015 s’est avérée l’une des meilleures de l’histoire de l’Université. Le programme était devenu stagnant et prévisible., Ferentz a mis en œuvre de nouveaux appels et techniques de jeu spontanés qui ont été surnommés « New Kirk » par les fans et les médias. Iowa est resté invaincu en saison régulière et a enregistré 12 victoires, le plus dans l’histoire de l’école. De plus, une équipe qui a fait 0-4 dans les matchs de trophée l’année précédente, a fait 4-0 et a remporté le championnat de la Big Ten Conference West, le premier de l’histoire de l’école. Ferentz a également été nommé entraîneur Big Ten de l’année pour la quatrième fois alors qu’il était à Iowa. Les Hawkeyes sont tombés 16-13 dans le match de championnat de football Big Ten 2015 contre Michigan State., Malgré la défaite, les Hawkeyes ont accepté une invitation au Rose Bowl 2016, le troisième Rose Bowl de Ferentz avec L’Iowa, d’abord en tant qu’entraîneur-chef, et il marque le premier voyage à Pasadena pour les Hawkeyes en 25 ans. Dans le Rose Bowl, les Hawkeyes ont été étranglés, 45-16, par une équipe de Stanford dirigée par Christian McCaffrey. Avec leur dernière défaite Au Rose Bowl, les Hawkeyes sont tombés à 0-4, avec un score combiné de 164-78, depuis leur dernière victoire en 1959.

en 2016, Iowa a subi de nombreuses blessures qui les ont fait dérailler dans la première partie de la saison., Cependant, ils ont terminé fort en battant # 3 Michigan, et a prévalu sur #16 Nebraska, terminant avec un dossier de 8-4. La ligne offensive de L’Iowa a reçu le prix Joe Moore. Ce prix était particulièrement important parce que Moore était un mentor à vie pour Ferentz, et l’équipe a dû surmonter beaucoup de choses pour le gagner. Iowa a été sélectionné pour jouer dans L’Outback Bowl pour la cinquième fois sous Ferentz, où ils ont perdu contre les Gators de la Floride 30-3. Après la défaite contre les Gators, les Hawkeyes sont tombés à 0-5 lors de leurs cinq derniers matchs de bowl, se faisant dépasser 172-75 dans ces compétitions.,

la saison 2017 était presque une copie conforme de la saison précédente. Iowa a pris un bon départ, mais a de nouveau été en proie à plusieurs blessures. L’équipe est restée invaincue dans les matchs hors conférence et toutes les défaites de ses dix grosses équipes sauf deux l’ont été par un seul score (38-14 contre Wisconsin, 24-15 contre Purdue). Comme la saison précédente, Iowa est allé 3-1 dans les matchs de trophée, et a terminé avec huit victoires. Ils ont également été en mesure de battre #3 Ohio State pour la première fois depuis 2004. Iowa a joué dans le Pinstripe Bowl, le 15th bowl sous Ferentz., Après avoir traîné tôt, les Hawkeyes ont dominé la seconde moitié et ont remporté leur premier match de bowl depuis 2010. La victoire a égalé Hayden Fry dans les victoires en carrière dans L’Iowa (143), et a dépassé son nombre de victoires au bowl à l’Université.

la saison 2018 restera dans les mémoires pour les pertes de la conférence Big Ten qui ont coûté aux Hawkeyes un autre voyage à Indianapolis. Iowa a commencé fort, remportant ses trois matchs hors conférence, et a de nouveau été en mesure de conserver trois des quatre trophées de rivalité à Iowa City. Cependant, les pertes à Penn State, Purdue et Northwestern au cours de semaines consécutives ont défini la saison., Iowa a joué dans L’Outback Bowl pour la sixième fois, tenant le coup pour vaincre Mississippi State 27-22 pour la cinquième victoire de Ferentz janvier bowl et huitième victoire globale bowl.

2019 a été globalement une excellente année pour L’Iowa. Les Hawkeyes ont commencé 4-0, et sont restés invaincus contre des adversaires non-conférence. Après des défaites consécutives contre les grandes puissances du Michigan et de Penn State, il semblait que cela pourrait être une saison perdue pour l  » équipe. Iowa rallié, remportant cinq de leurs six derniers matchs, mais encore une autre défaite à archrival Wisconsin signifiait qu’un titre de la division Ouest Big Ten échappé au programme., Les Hawkeyes ont joué dans le Holiday Bowl contre USC. Dans le premier match entre les Trojans et Hawkeyes depuis L’Orange Bowl 2003, Iowa a battu USC dans une fusillade 49-24. La victoire a donné au programme dix victoires pour la sixième fois sous Ferentz. L’équipe a également été en mesure d’accomplir une distinction qui n’avait pas été faite depuis 1991, ils ont tous deux commencé et terminé la saison dans le top 25 des classements nationaux sans abandonner.

la saison 2020 court-circuitée par COVID-19 a été plutôt positive pour L’Iowa., Après une saison morte de turbulences au sein du programme, ils ont pu gagner six matchs et ont remporté 3-0 dans les concours de trophées, battant Wisconsin pour la première fois depuis 2015. Cependant, une défaite d’un point dans la deuxième semaine à Northwestern était la seule raison pour laquelle l’équipe a été tenue à l’écart du Championnat Big Ten contre Ohio State. Les Hawkeyes devaient jouer au Music City Bowl, qui aurait été la première fois que L’Iowa jouait au Missouri depuis 10 ans auparavant lors du Insight Bowl de 2010. Cependant, le match a été annulé trois jours avant le match en raison de problèmes de virus.,

en novembre 2020, Ferentz est 16-6 contre son grand rival du Minnesota et 12-9 contre son rival de L’État de L’Iowa, bien que son prédécesseur soit allé 16-4 contre son rival de l’état. Ferentz a signé sa 100e victoire en carrière à Iowa avec une victoire en double prolongation contre les Spartans de Michigan State à East Lansing le 13 octobre 2012. Il est devenu le leader des Victoires de tous les temps dans l’histoire de l’école, (144) avec une victoire sur Northern Illinois le 1er septembre 2018, et a conduit L’Iowa à 17 matchs de bowl, plus de bowls que tout autre entraîneur de L’Iowa., Plus tard dans la saison, Ferentz a enregistré sa 150e victoire en carrière dans l’Iowa avec un triomphe sur Big Ten Foe Illinois le 17 novembre 2018. Lorsque Joe Paterno a été renvoyé de Penn State en 2011, Ferentz est devenu le doyen des entraîneurs de football Big Ten, en tant qu’entraîneur titulaire le plus longtemps dans le sport respectif. Avec la retraite de L’entraîneur de Virginia Tech Frank Beamer après la saison 2015, Ferentz est devenu à égalité avec Bob Stoops pour l’entraîneur-chef titulaire le plus longtemps au niveau FBS. En juin 2017, Ferentz est devenu l’entraîneur titulaire le plus longtemps avec la retraite soudaine de Bob Stoops.,

Le 6 juin 2020, Ferentz a mis L’entraîneur de force Chris Doyle en congé administratif payé après qu’un certain nombre d’anciens joueurs ont identifié Doyle et Brian Ferentz comme contribuant à une culture du programme hostile envers les étudiants-athlètes noirs. Le 15 juin, Doyle a été libéré du programme après un passage de 21 ans.

le 27 juillet 2020, ESPN a publié un article citant des cas d’inégalités raciales imposées aux joueurs noirs tout au long du mandat de Ferentz en tant qu’entraîneur-chef., Un ancien joueur, Dace Richardson, a été cité en disant: « J » ai parlé avec des gars et ils ont parlé de la façon dont ils ont été faits pour se conformer à ce que l « entraîneur Ferentz voulait ou ce qu » ils attendaient des joueurs blancs, nous avions beaucoup de gars dans notre équipe qui avaient des personnalités et ils n  » étaient pas autorisés Je n’ai jamais eu de problèmes avec ça parce que je me suis en quelque sorte conformé à ce que l’équipe voulait. »