Togon-temür se convirtió en emperador a la edad de 13 años, pero demostró ser un gobernante débil que prefirió pasar su tiempo explorando el culto religioso del lamaísmo y entreteniéndose con su harén en lugar de gobernar el país. En los primeros años de su reinado, el poder estaba en manos del ministro anti-Chino Bayan, quien suspendió los exámenes de Servicio civil, prohibió a los chinos usar ciertos colores o usar ciertos Ideogramas, e incluso propuso la ejecución masiva de chinos sobre la base de sus nombres., Las políticas discriminatorias de Bayan, junto con el deterioro de la situación económica del país, causaron una rebelión generalizada. En 1339 el ministro fue desterrado y muchas de sus políticas revertidas.

pero el emperador todavía mostró poco interés en gobernar, y la situación continuó deteriorándose. El Hijo de Togon-temür, el heredero aparente, se alarmó por el creciente poder que su padre estaba poniendo en manos de sacerdotes budistas y eunucos y conspiró sin éxito para deponerlo., En 1368, cuando el líder rebelde más importante, Zhu Yuanzhang (1328-98), avanzó sobre la capital en Dadu (ahora Pekín), Togon-temür desestimó las apelaciones que le instaban a quedarse y defender su herencia. En cambio, huyó a las estepas de Mongolia Interior y murió allí dos años más tarde, poniendo fin a la dinastía. Los mongoles le dieron el nombre póstumo de Huizong («Antepasado gentil»), pero generalmente se le conoce como Shundi («Emperador favorable»), un título que le dio la dinastía Ming (1368-1644).