Il 2 dicembre 1998, Ferentz fu assunto come 26 ° capo allenatore dell’Iowa per sostituire il dimissionario Hayden Fry. La squadra ha lottato durante le prime due stagioni di Ferentz con un record combinato di 4-19, ma gli Hawkeyes hanno guadagnato la loro prima offerta bowl dell’era Ferentz dopo una stagione 7-5 nel 2001. Hanno battuto Texas Tech nell’Alamo Bowl, 19-16.

La stagione 2002 si sarebbe rivelata memorabile per Ferentz e gli Hawkeyes. La squadra terminò la stagione regolare con un record di 11-1; la sua unica sconfitta arrivò a Iowa State., Hanno condiviso il campionato Big Ten Conference con Ohio State, come entrambe le squadre finito 8-0 in conference play. Quarterback Brad Banks ha vinto il Davey O’Brien Award per il miglior quarterback e finito secondo nel Heisman Trophy ballottaggio a Carson Palmer della USC. Il tight end Dallas Clark è stato il vincitore del premio John Mackey di quella stagione, e il placekicker Nate Kaeding è stato il vincitore del premio Lou Groza. Ferentz è stato nominato Allenatore dell’anno dall’Associated Press per i suoi sforzi. Iowa ha ricevuto il suo primo invito BCS, perdendo contro USC nel 2003 Orange Bowl, 38-17.,

Nonostante la perdita di diversi anziani alla laurea, gli Hawkeyes compilato un record di 9-3 stagione regolare nel 2003. Sconfissero la Florida 37-17 nell’Outback Bowl il 1º gennaio 2004, per la loro prima vittoria di gennaio dal 1959. Questo ha guadagnato gli Hawkeyes un # 8 classifica nazionale sia nel sondaggio AP e Allenatori Sondaggio alla fine della stagione. L’offensive tackle Robert Gallery fu il vincitore dell’Outland Trophy di quella stagione; dopo la stagione, gli Oakland Raiders lo scelsero con la seconda scelta assoluta nel Draft NFL 2004.,

Ferentz ha dovuto affrontare diversi infortuni ai running back degli Hawkeyes e la morte di suo padre, John, durante la stagione 2004. Tuttavia, gli Hawkeyes compilarono un record di stagione regolare 9-2, condividendo il campionato Big Ten Conference con Michigan dopo una vittoria 30-7 sul Wisconsin il 20 novembre. Per la seconda volta in tre stagioni, Ferentz è stato nominato allenatore della Big Ten Conference dell’anno. Il 1º gennaio 2005, sconfissero LSU, 30-25, dopo un emozionante passaggio da touchdown da 56 yard da Drew Tate a Warren Holloway allo scadere del tempo nel Capital One Bowl., Questo ha dato Ferentz la sua terza stagione consecutiva dieci vittorie con gli Hawkeyes e un altro #8 classifica nazionale.

Gli Hawkeyes sono andati 7-4 durante la stagione regolare 2005. Dopo le sconfitte di inizio stagione a Iowa State e Ohio State e le sconfitte ravvicinate a Michigan e Northwestern, finirono la stagione con vittorie su Wisconsin e Minnesota per guadagnare un secondo viaggio all’Outback Bowl per affrontare la Florida il 2 gennaio 2006. Questa volta, però, i Gators hanno ottenuto una misura di vendetta per la loro perdita di due anni prima, come gli Hawkeyes perso in Florida, 31-24., Molto è stato detto circa l’officiante in questo gioco, come ci sono stati 13 chiamate perse o cattive fatte contro gli Hawkeyes che hanno influenzato direttamente il risultato. La NCAA ha fatto un riconoscimento ufficiale di questo problema.

Iowa ha iniziato la stagione 2006 forte, vincendo le prime quattro partite prima di perdere contro il top-ranked Ohio State. Dopo un inizio 5-1, tuttavia, gli Hawkeyes crollarono lungo il tratto, perdendo cinque delle ultime sei partite. Iowa ha subito perdite scioccanti a Northwestern e Indiana e ha perso partite di rivalità con Wisconsin e Minnesota., Gli Hawkeyes terminarono la stagione regolare con un record di 6-6 e accettarono un invito all’Alamo Bowl 2006, la sesta partita consecutiva dello Iowa. Giocando come perdenti di nove punti ai campioni nazionali in carica del Texas, Iowa ha perso l’Alamo Bowl con un punteggio di 26-24.

Nel 2007, gli Hawkeyes di Ferentz iniziarono 2-4 e persero le loro prime tre partite di conference. Una vittoria contro l’Illinois ha concluso una serie di sconfitte per Iowa, e gli Hawkeyes hanno chiuso la stagione dei Big Ten vincendo le ultime tre partite della conference., Tuttavia, una sconfitta deludente nel finale di stagione a Western Michigan ha fatto cadere il record stagionale degli Hawkeyes a 6-6. Anche se Iowa era ciotola ammissibili, gli Hawkeyes non ha ricevuto un’offerta ciotola, scattando striscia di Iowa di sei apparizioni consecutive ciotola.

Nel 2008, Ferentz e gli Hawkeyes iniziarono forte con vittorie sulla sua vecchia squadra, Maine, Florida International e rivale Iowa State, ma le sconfitte ravvicinate contro Pitt, Northwestern e Michigan State lasciarono Iowa con un record di 3-3. Iowa poi ha continuato a vincere cinque dei loro prossimi sei giochi, tra cui un 24-23 sconvolto #3 classificato e imbattuto Penn State., Dopo aver terminato la stagione regolare a 8-4, Iowa ha accettato un invito per l’Outback Bowl dove hanno sconfitto i South Carolina Gamecocks, 31-10.

La squadra di calcio Hawkeye 2009 ha avuto il miglior inizio nella storia della scuola fino a quel momento. Vittorie casalinghe strette su Northern Iowa e Arkansas State accoppiate con vittorie su strada a due cifre su Penn State e Wisconsin hanno alimentato un inizio 7-0., Ferentz ‘ 2009 Hawks divenne la prima squadra Iowa a vincere otto partite per iniziare una stagione vincendo a Michigan State, 15-13, con un passaggio da touchdown sul gioco finale della partita. Dopo aver sconfitto Indiana per eseguire il loro record di 9-0, gli Hawks perso quarterback Ricky Stanzi per infortunio in una perdita sconvolto a Northwestern. Iowa poi ha perso il de facto Big Ten championship game a Ohio State, 27-24, in overtime. Gli Hawkeyes hanno chiuso Minnesota, 12-0, per finire la stagione regolare con un record di 10-2 e sono stati selezionati per il loro secondo BCS bowl game sotto Ferentz venendo invitati all’Orange Bowl 2010., Iowa ha sconfitto Georgia Tech, 24-14, per guadagnare la prima vittoria BCS bowl della scuola e la loro prima vittoria in una ciotola di livello BCS dal 1959 Rose Bowl. Iowa finito con un record di 11-2 che ha legato il record della scuola per le vittorie in una stagione e gli Hawkeyes guadagnato #7 classifica sia nel sondaggio AP e Allenatori Sondaggio, il loro più alto fin dalla stagione 1960.

Dopo tre stagioni mediocri in cui Iowa è andato solo un combinato 19-19 e una sconfitta umiliante nel Taxslayer Bowl, la stagione 2015 si è rivelata una delle migliori nella storia dell’università. Il programma era diventato stagnante e prevedibile., Ferentz ha implementato nuove chiamate e tecniche di gioco spontanee che sono state soprannominate “New Kirk” dai fan e dai media. Iowa è andato imbattuto nella stagione regolare e ha registrato 12 vittorie, il più nella storia della scuola. Inoltre, una squadra che è andata 0-4 nelle partite dei trofei l’anno prima, è andata 4-0 e ha vinto il campionato Big Ten Conference West, il primo nella storia della scuola. Ferentz è stato anche nominato Big Ten allenatore dell’anno per la quarta volta mentre a Iowa. Gli Hawkeyes sono caduti 16-13 nella partita del campionato di calcio Big Ten 2015 contro Michigan State., Nonostante la sconfitta, gli Hawkeyes hanno accettato un invito al Rose Bowl 2016, il terzo Rose Bowl di Ferentz con Iowa, il primo come capo allenatore, e segna il primo viaggio a Pasadena per gli Hawkeyes in 25 anni. Nel Rose Bowl, gli Hawkeyes furono strozzati, 45-16, da una squadra di Stanford guidata da Christian McCaffrey. Con la loro ultima sconfitta al Rose Bowl, gli Hawkeyes caddero a 0-4, con un punteggio combinato di 164-78, dalla loro ultima vittoria nel 1959.

Nel 2016, Iowa ha subito numerosi infortuni che li hanno deragliati nella prima parte della stagione., Tuttavia, hanno finito forte battendo # 3 Michigan, e prevalso su #16 Nebraska, finendo con un record di 8-4. La linea offensiva Iowa è stato assegnato il Joe Moore Award. Questo premio è stato particolarmente significativo perché Moore è stato un mentore per tutta la vita di Ferentz, e la squadra ha dovuto superare molto per vincerlo. Iowa è stato selezionato per giocare nella Outback Bowl per la quinta volta sotto Ferentz, dove hanno perso contro i Florida Gators 30-3. Dopo la sconfitta contro gli Gators, gli Hawkeyes sono scesi a 0-5 nelle ultime cinque partite del bowl, superando 172-75 in quelle gare.,

La stagione 2017 è stata quasi una copia carbone della stagione precedente. Iowa ha ottenuto fuori ad un grande inizio, ma è stato di nuovo afflitto da diverse lesioni. La squadra è rimasta imbattuta nel gioco non-conference e tutte tranne due delle loro Big Ten perdite sono state di un solo punteggio (38-14 vs. Wisconsin, 24-15 vs. Purdue). Come la stagione precedente, Iowa è andato 3-1 nei giochi trofeo, e finito con otto vittorie. Sono stati anche in grado di battere #3 Ohio State per la prima volta dal 2004. Iowa ha giocato nel Pinstripe Bowl, il 15 ° bowl sotto Ferentz., Dopo aver perso in anticipo, gli Hawkeyes hanno dominato la seconda metà e hanno vinto la loro prima partita di bowl dal 2010. La vittoria ha legato Hayden Fry nelle vittorie in carriera Iowa (143), e ha superato il suo numero di vittorie bowl all’università.

La stagione 2018 sarà ricordata per le perdite ravvicinate della Big Ten Conference che costarono agli Hawkeyes un altro viaggio a Indianapolis. Iowa ha iniziato forte, vincendo i suoi tre giochi non-conference, e ancora una volta è stato in grado di mantenere tre dei quattro trofei rivalità a Iowa City. Tuttavia, le perdite a Penn State, Purdue e Northwestern in settimane consecutive hanno definito la stagione., Iowa ha giocato nell’Outback Bowl per la sesta volta, aggrappandosi a sconfiggere Mississippi State 27-22 per Ferentz quinto gennaio bowl vittoria e ottava vittoria complessiva bowl.

Il 2019 è stato nel complesso un grande anno per l’Iowa. Il Hawkeyes iniziato 4-0, ed è andato imbattuto contro avversari non-conference. Dopo le perdite back-to-back contro Big Ten powerhouses Michigan e Penn State sembrava che potrebbe essere una stagione persa per la squadra. Iowa radunato, vincendo cinque delle ultime sei partite, ma ancora un ” altra perdita di archrival Wisconsin significava che un Big Ten West division titolo eluso il programma., Gli Hawkeyes hanno giocato nell’Holiday Bowl contro USC. Nel primo match-up tra i Trojans e Hawkeyes dal 2003 Orange Bowl Iowa superato USC in una sparatoria 49-24. La vittoria ha dato al programma dieci vittorie per la sesta volta sotto Ferentz. La squadra è stata anche in grado di realizzare una distinzione che non era stata fatta dal 1991, entrambi hanno iniziato e finito la stagione nella top 25 classifica nazionale senza abbandonare.

La stagione 2020 in corto COVID-19 è stata per lo più positiva per l’Iowa., Dopo una offseason di turbolenze all’interno del programma sono stati in grado di vincere sei partite, ed è andato 3-0 in gare trofeo, sconfiggendo Wisconsin per la prima volta dal 2015. Tuttavia, una perdita di un punto nella seconda settimana a Northwestern è stata l’unica ragione per cui la squadra è stata tenuta fuori dal campionato Big Ten contro Ohio State. Gli Hawkeyes sono stati programmati per giocare nel Music City Bowl, che sarebbe stata la prima volta Iowa aveva giocato Missouri da 10 anni prima nel 2010 Insight Bowl. Tuttavia, il gioco è stato annullato tre giorni prima del match-up per problemi di virus.,

A partire da novembre 2020, Ferentz è 16-6 contro il rivale Big Ten Minnesota e 12-9 contro il rivale in stato Iowa State, anche se il suo predecessore è andato 16-4 contro il loro rivale in stato. Ferentz ha segnato la sua 100a vittoria in carriera in Iowa con una vittoria a doppio overtime sui Michigan State Spartans a East Lansing il 13 ottobre 2012. È diventato il leader delle vittorie di tutti i tempi nella storia della scuola, (144) con una vittoria su Northern Illinois a settembre 1, 2018, e ha portato Iowa a 17 bowl games, più ciotole di qualsiasi altro allenatore Iowa., Più tardi quella stagione Ferentz ha registrato la sua 150th vittoria in carriera Iowa con un trionfo blowout sopra Big Ten nemico Illinois novembre 17, 2018. Quando Joe Paterno è stato licenziato da Penn State in 2011 Ferentz è diventato il decano di Big Ten allenatori di calcio, come il più lungo allenatore di ruolo nel rispettivo sport. Con il ritiro dell’allenatore della Virginia Tech Frank Beamer dopo la stagione 2015, Ferentz è diventato legato a Bob Stoops per il più lungo allenatore di ruolo a livello FBS. Nel giugno 2017, Ferentz è diventato il più lungo allenatore di ruolo con l’improvviso ritiro di Bob Stoops.,

Il 6 giugno 2020, Ferentz ha messo l’allenatore Chris Doyle in congedo amministrativo retribuito dopo che un certo numero di ex giocatori ha identificato Doyle e Brian Ferentz come un contributo a una cultura del programma ostile nei confronti degli studenti-atleti neri. Il 15 giugno, Doyle è stato rilasciato dal programma dopo un periodo di 21 anni.

Il 27 luglio 2020, ESPN ha pubblicato un articolo citando casi di iniquità razziali applicate contro i giocatori di colore durante il mandato di Ferentz come capo allenatore., Un ex giocatore, Dace Richardson, è stato citato dicendo ” Ho parlato con i ragazzi e hanno parlato di come sono stati fatti per conformarsi a ciò che l’allenatore Ferentz voleva o come si aspettavano che i giocatori bianchi fossero, abbiamo avuto un sacco di ragazzi nella nostra squadra che avevano personalità e non erano autorizzati a essere loro stessi naturali. Non ho mai avuto problemi con questo perché mi sono appena conformato a ciò che la squadra voleva.”