pe 2 decembrie 1998, Ferentz a fost angajat ca antrenor de fotbal 26th din Iowa pentru a înlocui Hayden Fry care se retrage. Echipa s-a luptat în primele două sezoane ale lui Ferentz cu un record combinat 4-19, dar Hawkeyes a câștigat prima ofertă de bowl din Era Ferentz după un sezon 7-5 în 2001. Au bătut Texas Tech în Alamo Bowl, 19-16.sezonul 2002 s-ar dovedi a fi memorabil pentru Ferentz și Hawkeyes. Echipa a terminat sezonul regulat cu un record 11-1; singura sa pierdere venind în statul Iowa., Au împărțit Campionatul de conferințe Big Ten cu Ohio State, deoarece ambele echipe au terminat 8-0 în jocul conferinței. Quarterback Brad Banks a câștigat Premiul Davey O ‘ Brien pentru cel mai bun fundas si a terminat al doilea în Heisman Trophy votarea Carson Palmer de USC. Tight end Dallas Clark a fost câștigătorul Premiului John Mackey din acel sezon, iar placekicker Nate Kaeding a fost câștigătorul Premiului Lou Groza. Ferentz a fost numit antrenorul anului de către Associated Press pentru eforturile sale. Iowa a primit prima sa invitație BCS, pierzând la USC în 2003 Orange Bowl, 38-17.,în ciuda pierderii mai multor seniori la absolvire, Hawkeyes a compilat un record de sezon regulat 9-3 în 2003. Au învins Florida 37-17 în Outback Bowl pe 1 ianuarie 2004, pentru prima lor victorie din ianuarie de la 1959. Acest lucru a câștigat Hawkeyes un Clasament național # 8 atât în sondajul AP, cât și în sondajul antrenorilor la sfârșitul sezonului. Abordarea ofensivă Robert Gallery a fost câștigătorul trofeului Outland din acel sezon; după sezon, Oakland Raiders l-a ales cu a doua alegere generală în proiectul 2004 NFL.,Ferentz a avut de-a face cu mai multe răni la spatele lui Hawkeyes și moartea tatălui său, John, în timpul sezonului 2004. Cu toate acestea, Hawkeyes a compilat un record de sezon regulat 9-2, împărtășind Campionatul de conferințe Big Ten cu Michigan după o victorie 30-7 asupra Wisconsinului în noiembrie 20. Pentru a doua oară în trei sezoane, Ferentz a fost numit antrenorul Conferinței Big Ten al anului. Pe 1 ianuarie 2005, au învins LSU, 30-25, după o pasă palpitantă de 56 de metri de la Drew Tate la Warren Holloway, pe măsură ce timpul a expirat în capitala One Bowl., Acest lucru i-a oferit lui Ferentz al treilea sezon consecutiv de zece victorii cu Hawkeyes și un alt Clasament național #8.

Hawkeyes a mers 7-4 în timpul sezonului regulat 2005. După pierderile de la începutul sezonului în statul Iowa și statul Ohio și pierderile apropiate în Michigan și Northwestern, au terminat sezonul cu victorii peste Wisconsin și Minnesota pentru a câștiga oa doua călătorie în Outback Bowl pentru a face față Floridei pe 2 ianuarie 2006. De data aceasta, însă, gatorii au primit o măsură de răzbunare pentru pierderea lor cu doi ani mai devreme, deoarece Hawkeyes a pierdut în Florida, 31-24., S-au spus multe despre oficializarea în acest joc, deoarece au fost 13 apeluri ratate sau proaste făcute împotriva Hawkeyes care au influențat direct rezultatul. NCAA a făcut o recunoaștere oficială a acestei probleme.

Iowa a început sezonul 2006 puternic, câștigând primele patru jocuri înainte de a pierde la Ohio State de top. După un start 5-1, însă, Hawkeyes s-a prăbușit pe întindere, pierzând cinci din ultimele șase jocuri. Iowa a suferit pierderi șocante la Northwestern și Indiana și a pierdut jocuri rivalitate cu Wisconsin și Minnesota., Hawkeyes a terminat sezonul regulat cu un record 6-6 și a acceptat o invitație la 2006 Alamo Bowl, al șaselea joc de bowl din Iowa. Jucând ca underdogs de nouă puncte pentru apărarea campionilor naționali Texas, Iowa a pierdut Alamo Bowl cu un scor de 26-24.în 2007, Ferentz ‘ Hawkeyes a început 2-4 și a pierdut primele trei jocuri de conferințe. O victorie supărată asupra lui Illinois a încheiat o serie de conferințe de nouă jocuri pentru Iowa, iar Hawkeyes a închis sezonul Big Ten câștigând ultimele trei jocuri de conferințe., Cu toate acestea, o pierdere dezamăgitoare în finalul sezonului la Western Michigan a scăzut recordul sezonului Hawkeyes la 6-6. Deși Iowa a fost eligibil pentru castron, Hawkeyes nu a primit o ofertă de castron, rupând șirul de șase apariții consecutive ale Cupei Iowa.în 2008, Ferentz și Hawkeyes au început puternic cu victorii asupra vechii sale echipe, Maine, Florida International și rivalul Iowa State, dar pierderile apropiate de Pitt, Northwestern și Michigan State au lăsat Iowa cu un record 3-3. Iowa apoi a continuat să câștige cinci din următoarele șase jocuri, inclusiv un 24-23 supărat de # 3 clasat și neînvins Penn State., După terminarea sezonului regulat la 8-4, Iowa a acceptat o invitație la Outback Bowl unde au învins Carolina de Sud Gamecocks, 31-10.

echipa de fotbal Hawkeye din 2009 a început cel mai bun start din istoria școlii până în acel moment. Victorii acasă înguste peste nordul Iowa și Arkansas State cuplat cu victorii rutiere cu două cifre peste Penn State și Wisconsin alimentat un start 7-0., Ferentz ‘ 2009 Hawks a devenit prima echipă din Iowa care a câștigat opt meciuri pentru a începe un sezon câștigând la Michigan State, 15-13, cu o pasă de touchdown pe jocul final al jocului. După ce a învins Indiana pentru a-și înregistra recordul la 9-0, Hawks a pierdut fundașul Ricky Stanzi la rănire într-o pierdere supărată față de Northwestern. Iowa a pierdut apoi de facto Big Ten championship game la Ohio State, 27-24, în prelungiri. Hawkeyes a închis Minnesota, 12-0, pentru a termina sezonul regulat cu un record 10-2 și au fost selectați pentru al doilea joc BCS bowl sub Ferentz, fiind invitați la 2010 Orange Bowl., Iowa a învins Georgia Tech, 24-14, pentru a câștiga prima victorie BCS bowl a școlii și prima victorie într-un castron BCS de la 1959 Rose Bowl. Iowa a terminat cu un record 11-2 care a legat recordul școlar pentru victorii într-un sezon, iar Hawkeyes a obținut clasamentele #7 atât în sondajul AP, cât și în sondajul antrenorilor, cel mai înalt finisaj de la sezonul 1960.după trei sezoane mediocre în care Iowa a mers doar un 19-19 combinat și o înfrângere umilitoare în bolul Taxslayer, sezonul 2015 s-a dovedit a fi unul dintre cele mai bune din istoria Universității. Programul devenise stagnant și previzibil., Ferentz a implementat noi apeluri de joc spontane și tehnici care au fost numite „New Kirk” de către fani și mass-media deopotrivă. Iowa a fost neînvinsă în sezonul regulat și a înregistrat 12 victorii, Cele mai multe din istoria școlii. În plus, o echipă care a mers 0-4 în jocurile de trofee cu un an înainte, a mers 4-0 și a câștigat Campionatul Big Ten Conference West, primul din istoria școlii. Ferentz a fost, de asemenea, numit Big Ten antrenorul anului pentru a patra oară în timp ce la Iowa. Hawkeyes a căzut 16-13 în 2015 Big Ten Football Championship joc împotriva Michigan State., În ciuda pierderii, Hawkeyes a acceptat o invitație la 2016 Rose Bowl, al treilea Rose Bowl al lui Ferentz cu Iowa, mai întâi ca antrenor principal, și marchează prima călătorie la Pasadena pentru Hawkeyes în 25 ani. În Rose Bowl, Hawkeyes au fost accelerați, 45-16, de un Christian McCaffrey a condus echipa Stanford. Cu ultima lor înfrângere Rose Bowl, Hawkeyes a scăzut la 0-4, cu un scor combinat de 164-78, de la ultima lor victorie în 1959.în 2016, Iowa a suferit numeroase leziuni care le-au deraiat în partea anterioară a sezonului., Cu toate acestea, au terminat bătaia puternică #3 Michigan și au predominat peste #16 Nebraska, terminând cu un record 8-4. Linia ofensivă Iowa a primit Premiul Joe Moore. Acest premiu a fost deosebit de important, deoarece Moore a fost un mentor pe tot parcursul vieții pentru Ferentz, iar echipa a trebuit să depășească multe pentru a-l câștiga. Iowa a fost selectat pentru a juca în Outback Bowl pentru a cincea oară sub Ferentz, unde au pierdut la Florida Gators 30-3. În urma pierderii la Gators, Hawkeyes a căzut la 0-5 în ultimele cinci jocuri de castron, obținând 172-75 în acele concursuri.,sezonul 2017 a fost aproape o copie de carbon a sezonului precedent. Iowa a pornit la un început excelent, dar a fost din nou afectat de mai multe leziuni. Echipa a plecat neînvinsă în non-joc de conferințe și toate, dar doi din cei Zece Mari pierderi au fost de doar un singur scor (38-14 vs Wisconsin, 24-15 ma vs Purdue). Ca și sezonul precedent, Iowa a mers 3-1 în jocurile de trofee și a terminat cu opt victorii. Ei au fost, de asemenea, posibilitatea de a bate #3 Ohio State pentru prima dată de la 2004. Iowa a jucat în Pinstripe Bowl, al 15-lea castron sub Ferentz., După ce a trecut mai devreme, Hawkeyes a dominat a doua jumătate și a câștigat primul lor joc de bowl de la 2010. Victoria legat Hayden Fry în Iowa câștigă cariera (143), și a depășit numărul său de bowl câștigă la universitate.

sezonul 2018 va fi amintit pentru pierderile apropiate ale Conferinței Big Ten care i-au costat pe Hawkeyes o altă călătorie în Indianapolis. Iowa a început puternic, câștigând cele trei jocuri non-conferințe și, din nou, a reușit să păstreze trei dintre cele patru trofee de rivalitate din Iowa City. Cu toate acestea, pierderile la Penn State, Purdue și Northwestern în săptămâni consecutive au definit sezonul., Iowa a jucat în Outback Bowl pentru a șasea oară, exploatație pe pentru a învinge Mississippi State 27-22 pentru Ferentz a cincea victorie ianuarie bowl și a opta victorie generală bowl.

2019 a fost în general un an minunat pentru Iowa. Hawkeyes a început 4-0, și a mers neînvins împotriva adversarilor non-conferință. După pierderi de back-to-back împotriva Big Ten powerhouses Michigan și Penn State, părea că ar putea fi un sezon pierdut pentru echipă. Iowa s-au raliat, câștigând cinci din ultimele șase jocuri, dar încă o altă pierdere la archrival Wisconsin a însemnat că un titlu Big Ten West division eludat programul., Hawkeyes a jucat în bolul de vacanță împotriva USC. În primul meci dintre troieni și Hawkeyes de la 2003 Orange Bowl Iowa a depășit USC într-un schimb de focuri 49-24. Victoria a dat programului zece victorii pentru a șasea oară sub Ferentz. Echipa a reușit, de asemenea, să realizeze o distincție care nu a fost făcută din 1991, amândoi au început și au terminat sezonul în primele 25 de clasamente naționale fără a renunța.

sezonul 2020 scurtat de COVID-19 a fost unul în mare parte pozitiv pentru Iowa., După un offseason de turbulențe în cadrul programului au reușit să câștige șase jocuri, și a mers 3-0 în concursuri trofeu, învingând Wisconsin pentru prima dată de la 2015. Cu toate acestea, o pierdere de un punct în săptămâna a doua la Northwestern a fost singurul motiv pentru care echipa a fost ținută în afara campionatului Big Ten împotriva Statului Ohio. Hawkeyes au fost programate să joace în Music City Bowl, care ar fi fost prima dată când Iowa a jucat Missouri de la 10 ani înainte în 2010 Insight Bowl. Cu toate acestea, jocul a fost anulat cu trei zile înainte de meci din cauza preocupărilor legate de virus.,în Noiembrie 2020, Ferentz este 16-6 față de rivalul Big Ten Minnesota și 12-9 față de rivalul din statul Iowa, deși predecesorul său a mers cu 16-4 împotriva rivalului lor din stat. Ferentz crestat cariera 100th victorie la Iowa cu o victorie dublu-prelungiri peste Spartanii Michigan State în East Lansing octombrie 13, 2012. El a devenit liderul all-time wins în istoria școlii, (144) cu o victorie asupra Illinois de Nord septembrie 1, 2018, și a condus Iowa la 17 jocuri castron, mai multe boluri decât orice alt antrenor Iowa., Mai târziu, în acel sezon, Ferentz a înregistrat cea de-a 150-a victorie în cariera Iowa, cu un triumf de lovitură peste Big Ten foe Illinois pe 17 noiembrie 2018. Când Joe Paterno a fost concediat de la Penn State în 2011, Ferentz a devenit decanul antrenorilor de fotbal Big Ten, fiind cel mai lung antrenor titular din sportul respectiv. Odată cu retragerea antrenorului Virginia Tech Frank Beamer după sezonul 2015, Ferentz a devenit legat de Bob Stoops pentru cel mai lung antrenor principal titular la nivelul FBS. În iunie 2017, Ferentz a devenit cel mai lung antrenor titular odată cu retragerea bruscă a lui Bob Stoops.,

Pe 6 iunie, în 2020, Ferentz plasate puterea antrenorul Chris Doyle plătit concediu, după o serie de foști jucători identificate Doyle și Brian Ferentz ca contribuie la un program de cultură care a fost ostil față de student negru-sportivi. Pe 15 iunie, Doyle a fost eliberat din program după o perioadă de 21 de ani.

în iulie 27, 2020, ESPN a publicat un articol citând cazuri de inechități rasiale percepute împotriva jucătorilor negri de-a lungul mandatului lui Ferentz ca antrenor principal., Un fost jucător, Dace Richardson, a fost citat spunând: „am vorbit cu băieții și au vorbit despre cum au fost făcute pentru a se conforma la ceea ce Antrenor Ferentz a vrut sau ceea ce au așteptat jucătorii alb să fie, am avut o mulțime de băieți în echipa noastră, care a avut personalități și nu aveau voie să fie sinele lor naturale. Nu am avut niciodată probleme cu asta pentru că m-am conformat doar la ceea ce dorea echipa.”